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1. 两种模式的主要计价方法不同
工程量清单计价采用综合单价计价,是有别于现行定额工料机单价计价的另一种计价方法。综合单价计价包括完成规定计量单位合格产品的全部费用，含人工费、材料费、机械使用费、管理费、利润并考虑风险因素(除规费、税金以外的全部费用)，综合单价不但适用于分部分项工程量清单，也适用于措施项目清单以及其他项目清单。工程量清单计价反映的是企业个别成本。
定额计价中的预算定额，人、材、机消耗量是国家根据有关规范、标准以及社会平均水平来确定的，费用标准是根据不同地区平均水平测算的，定额计价反映的是社会平均成本。
2. 两种模式的工程量计算方式不同
定额计价的工程量，一律由承包方负责计算，计算规则执行的是计价定额(即消耗量定额)的规定，由发包方进行审核。
清单计价的工程量来源于两个方面：一是清单项目的工程量，由清单编制人根据《计价规范》各附录和宁夏回族自治区补充项目中的工程量计算规则计算，并填写工程量清单作为招标文件的一部分发至投标人。二是组成清单项目的各个定额分项工程的工程量，由投标人根据计价定额规定的工程量计算规则计算，并执行相应计价定额组成综合单价。
3. 两种模式的生产要素不同
定额计价时，工料机价格是取定价格。即使存在动态调整，其调整的标准也是造价管理部门发布的市场信息价格。这种市场信息价格只反映不同时期的变动情况,而在同一时期内,它是一种平均价格,不同的施工企业均按这个平均价格找差,其结果不反映企业的管理水平。
清单计价使用的工料机价格,是报价期内由企业的管理水平所决定的市场价格,在同一报价期内,不同投标人因其管理水平不同，工料机价格也是不同的。因此，清单计价时，使用的生产要素价格也具有多样性。
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